水果是鮮活食品，本身就不易于存放，碰撞、擠壓導致破皮厚更是容易腐爛，所以水果的運輸保護工作一定要做好，水果運輸包裝肯定要有外包裝，和內部的緩沖保護包裝。

現在常用于外包裝的是紙箱，它輕便、價格便宜，因而作為木箱的替代物，水果包裝中被廣泛使用。紙箱還有外觀光滑便于使用印刷的標簽和宣傳的優點，但紙箱比較薄不夠穩固，受到重物對呀極易變形、破損，所以單獨用于水果包裝就不太合適了，需要搭配內部包裝材料來做保護。

水果有制模放置包裝，也有散裝。制模放置包裝的好處是每個果實都放入適當的位置，能夠起到更好的保護，但是這種方法會因為水果種類、個頭大小不同而增加許多成本，會給企業帶來一定的壓力。

而散裝的方法是在包裝容器里鋪上緩沖氣泡墊后，放入水果然后輕輕晃動，以便商品相互挨緊，每層都用氣泡墊隔開做緩沖保護，利用氣泡墊氣泡的緩沖減震性能來保護水果的整個運輸過程。使用氣泡墊包裝無需開模，能夠節約大量成本，降低倉儲壓力。 

還有一個方法就是，使用針對性的雙層保護的充氣袋，即充氣袋中袋，將單個的水果放置內袋中，將外袋充氣，外袋膨脹將內袋中的水果全面覆蓋起來保護，從而水果能夠真正得到保護，即使是扔、拋、碰撞等情況下都能安然無恙。